Le musée, construit autour de 1870 comme une collection de pièces pathologiques des fins éducatives ou de recherche, est une partie intégrante de l’école de médecine. Depuis plus d’un siècle, ont été recueillies sur 1500 spécimens. Collections remarquables de bébés malformés et des calculs vésiculaires du siècle dernier. Le musée conserve également les dossiers de 20.000 autopsies effectuées à ce jour des commentaires de diagnostic de 1884 et marque l’inclusion de paraffine de biopsies de 500.000. Le musée historique possède une bibliothèque de 6000 volumes, dont les deux éditions précieuses d’Cruveilhier (1845) et diverses uvres originales Angiolo Maffucci (1848-1907) et Antonio Cesaris Daniel (1866-1938).